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T7启动子之体外转录

转录,是指遗传信息从基因DNA转移到RNA,在RNA聚合酶的作用下形成一条与DNA碱基序列互补的mRNA的过程,通常发生在生物体内。如果将含有RNA转录酶、NTP等条件,在体外无细胞系统中,以DNA作为模板,模仿体内转录过程生成RNA的过程被称为体外转录

T7启动子之体外转录

体外转录常用于cas9基因敲除鼠构建中,由受精卵原核期至2细胞期发育时间短暂,体内转录时间较长,不能在早期进行基因编辑。这就需要提前通过体外转录获得mRNA,通过显微注射技术将其注入原核期受精卵,以便在发育早期进行基因编辑。

T7启动子之体外转录

体外转录属于精细实验,其相关试剂盒价格比较昂贵,在操作中一定要熟知操作步骤。首先最重要的是,在整个操作过程中无RNA酶, 无RNA酶,无RNA酶,重要的事情说三遍,目的即防止转录后mRNA发生降解。包括:

(1)无RNA酶环境:超净台酒精消毒后,预先紫外照射至少30分钟。

(2)无RNA酶操作:操作过程勤换手套;带口罩,防止飞沫污染。

(3)无RNA酶试剂:Rnase-free EP管;Rnase-free 枪头;Rnase-free water。

下面就为大家介绍一下体外转录操作步骤。

1.首先,转录序列预先构建于T7启动子载体质粒,转录模板设计一般要求如下:

(1)在基因组全长克隆过程中,在正向引物的5’端添加T7启动子序列;

(2)以T7启动子作为体外转录启动子,一般启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最高;

(3)在正向引物5’端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。

2. 将含有T7启动子载体质粒进行酶切,获得线性化质粒;

(1)线性化T7质粒:

酶切体系:

10µg T7 质粒

10µl 10 X M buffer

5µl DraI酶(15U/ µl)

按照体系加入试剂,轻轻混匀,瞬时离心。然后置于37度水浴孵育3小时,孵育过程中间隔震荡一下,以便充分酶切。

(2)酶切后,取2 µl 产物于1%琼脂糖凝胶电泳,验证质粒是否线性化,可加入原始质粒作为参照,一般线性化质粒为两条带,原始质粒为三条带。不需要将线性化质粒进行胶回收。

(3)直接在酶切产物内加入4 µlRNA保护剂,60度孵育10分钟。

(4)用MinElute PCR Purification Kit纯化试剂盒按说明书回收酶切产物,最后加入10 µlRnase-free water进行溶解。

(5)NanoDrop测回收的线性化载体浓度。

3.体外转录,选用MEGAshort™ Kit试剂盒。

(1)体外转录:将回收的线性化载体进行转录。

体外转录体系:

4 µl 线性化质粒模板(至少2 µg)

1 μL T7 10X Reaction Buffer

1 μL T7 ATP Solution (75 mM)

1 μL T7 CTP Solution (75 mM)

1 μL T7 GTP Solution (75 mM)

1 μL T7 UTP Solution (75 mM)

1 μL T7 Enzyme Mix

按照上述体系加入试剂(共10 µl),注意在操作过程中将全部试剂至于冰上,依次加入试剂,最后加入T7转录酶。试剂全部加入后,轻轻混匀,将EP管瞬时离心。然后置于37度水浴孵育4-6小时。

(2)转录结束后,向试剂内加入1 μL TURBO DNase ,置于37度水浴孵育 15分钟,以便移除DNA模板。

(3)转录产物选用MEGAclear™ Kit按说明书纯化回收,最后加入30 μLRNase free water进行溶解。

(4)NanoDrop测转转录后mRNA浓度。可配置1% 琼脂糖凝胶电泳180 V 10 分钟,以验证转录后mRNA条带。

(5)分装,冻存于-80度冰箱。注意mRNA易降解,存储时选择小体积冻存,按需取用,取用时置于冰上。

体外转录的操作就介绍到这里了,从上述介绍不难发现整个过程需要用到多个试剂盒,在操作过程中也一定注意无RNA酶操作。同时最好全程将试剂至于冰上,防止降解。

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